Budget 2026: aides à l’innovation offrent un répit mais suscitent des inquiétudes

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Par : Claire Leblanc

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Adopté cette semaine par l’Assemblée nationale, le budget 2026 modifie plusieurs règles qui pèsent sur le financement de l’innovation en France. Pour Matthieu Bacquin, dirigeant de Finalli, certaines décisions évitent le pire pour les start-up technologiques, mais la direction générale reste insuffisante pour répondre aux besoins des PME et des entreprises deeptech.

Fondée à Bordeaux en 2016, Finalli accompagne près de 800 start‑up, PME et ETI dans l’obtention de soutiens publics à l’innovation — crédits d’impôt, subventions et autres dispositifs. Sa structure compte aujourd’hui 37 salariés et réalise environ 2,4 millions d’euros de chiffre d’affaires, ce qui donne au fondateur une vision opérationnelle des conséquences concrètes des mesures budgétaires.

Un relèvement contesté évité pour le statut JEI

Le texte initial prévoyait d’augmenter le seuil minimal de dépenses consacrées à la recherche‑développement pour conserver le statut de Jeune Entreprise Innovante. Passer la barre de 20 % à 25 % aurait durci les conditions d’accès pour de nombreuses sociétés en phase d’investissement intensif.

Selon Bacquin, l’abandon de cette hausse est une bonne nouvelle : beaucoup d’acteurs deeptech ont des cycles de développement et de commercialisation longs, souvent supérieurs à cinq ans, et auraient vu leur accès aux exonérations réduit de façon significative.

Un nouveau dispositif pour l’économie sociale et solidaire

Le budget introduit également un statut spécifique, baptisé JEI à impact, destiné aux entreprises de l’économie sociale et solidaire et à celles disposant de l’agrément ESUS. Ce régime fixe le seuil de dépenses en R&D à **5 %**, rendant l’accès beaucoup plus large pour des structures qui mêlent finalité sociale et projets innovants.

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Reste à préciser la mise en œuvre : décrets d’application, critères d’éligibilité détaillés et estimation du nombre d’entreprises concernées sont encore attendus, ce qui conditionnera l’effet réel de ce dispositif.

Le Crédit d’Impôt Innovation reste fragilisé

Autre point d’importance : le Crédit d’Impôt Innovation (CII) n’a pas bénéficié d’un réexamen favorable. Après avoir été réduit de 30 % à 20 % en 2025 — une baisse d’environ un tiers — le mécanisme n’a pas été restauré dans le budget 2026.

Pour Bacquin, cette absence de retour en arrière est préoccupante car le CII cible surtout les petites structures, souvent les plus dépendantes de ces aides pour transformer des prototypes en offres commercialisables.

Mesure Ce qui change Conséquences attendues
Statut JEI Hausse envisagée du seuil R&D (25 %) finalement abandonnée Soulagement pour les start‑up deeptech ; maintien de l’accès aux exonérations
JEI à impact Création d’un régime pour ESS/ESUS avec seuil R&D fixé à 5 % Ouverture à de nombreuses structures sociales innovantes ; effet dépendant des décrets
Crédit d’Impôt Innovation (CII) Taux réduit en 2025 de 30 % à 20 % ; pas de restauration en 2026 Moindre soutien financier pour les PME innovantes ; risque d’aléa dans la R&D
Finalli (contexte) Accompagnement de ~800 entreprises, 37 salariés Observation terrain des effets des mesures sur l’écosystème

Au‑delà des chiffres, la lecture de Matthieu Bacquin est double : il se félicite que l’Assemblée ait renoncé à durcir encore les critères d’éligibilité, mais déplore une approche budgétaire qui semble déconnectée des réalités de l’innovation en France.

Pour les prochains mois, les acteurs du secteur surveilleront trois éléments : la publication des textes d’application, l’estimation du nombre d’entreprises éligibles au nouveau statut, et la trajectoire future du soutien fiscal à la R&D. Ces points détermineront si le budget 2026 offre réellement un cadre stable pour la reprise et le développement des projets innovants.

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